Balai Teknik Sungai merupakan salah satu unit kerja Direktorat Jenderal Sumber Daya Air, Kementerian Pekerjaan Umum dan Perumahan Rakyat. Sesuai dengan Peraturan Menteri Pekerjaan Umum dan Perumahan Rakyat Nomor 26 Tahun 2020 tentang Perubahan atas Peraturan Menteri Pekerjaan Umum dan Perumahan Rakyat Nomor 16 Tahun 2020 Tentang Organisasi dan Tata Kerja Unit Pelaksana Teknis di Kementerian Pekerjaan Umum dan Perumahan Rakyat, Balai Teknik Sungai mempunyai tugas melaksanakan pengembangan, perekayasaan, dan pelaksanaan pelayanan teknis pengujian, pengkajian, inspeksi, dan sertifikasi di bidang sungai.

Dalam menjalani tugas dan fungsi, Balai Teknik Sungai dilengkapi dengan sarana laboratorium indoor dan outdoor, tenaga fungsional dari berbagai bidang dan jenjang keahlian, serta dukungan kerjasama dengan instansi pemerintah, perguruan tinggi, dunia usaha dan masyarakat. Menghadapi kendala dan permasalahan yang semakin kompleks di bidang sumber daya air dan persungaian pada khususnya, dibutuhkan strategi pendukung sumber daya air yang difokuskan pada upaya peningkatan keterpaduan tata kelola sumber daya air yang lebih akuntabel dan didukung oleh proses pengambilan keputusan yang lebih partisipatif dan demokratif dalam rangka terwujudnya kemanfaatan sumber daya air yang berkelanjutan. Diperlukan peningkatan peran Balai Teknik Sungai sebagai Unit Pelaksana Teknis dalam penerapan teknologi dan penggunaan laboratorium untuk meningkatkan keamanan bangunan air.

Dalam kurun waktu 30 tahun lebih, Balai Teknik Sungai telah banyak mengembangkan teknologi persungaian antara lain pengendalian banjir, perubahan morfologi sungai, agradasi dan degradasi dasar sungai, penanggulangan longsoran tebing sungai, dan dampak bencana banjir. Ke depan, kinerja jajaran Balai Teknik Sungai harus ditingkatkan untuk berperan menjawab permasalahan yang dihadapi di lapangan dan memberikan alternatif solusi yang inovatif sehingga mampu menghasilkan ilmu pengetahuan dan teknologi infrastruktur bidang sungai guna mendukung kualitas infrastruktur sumber daya air yang handal, lebih baik, lebih cepat, lebih murah dan berkelanjutan.